王大雁到幽冥船上去找妹妹，又与幽冥王的手下将左及众多活死人大战，在蒋云飞、面人爷爷、蛟鲨、小柔等的帮助下，打退了幽冥王的手下，小柔告知王大雁，妹妹没有死，而是被幽冥王带到了魔域王大雁不顾众人的劝说，前往魔域找妹妹，蛟鲨认为小柔是奸细，在途中又遇到伏击，蛟鲨的妹妹死去，众人终于到达魔域，幽冥王在船上现身。大家发现，小柔真的是奸细，众人与幽冥王大战，幽冥王要求王大雁用自己的心换妹妹及众人的性命，大家不愿王大雁为难，一一死去，王大雁被幽冥王打伤，幽冥船也被炸毁，就在幽冥王得意之际，小柔取了幽冥王的心脏，在海中漂流的王大雁醒来，故事远没有结束……

《深海巨妖2》的整体故事带有热血之感，配乐对情节有烘托作用，画面美感十足，人物刻画非常立体，该片剧情环环相扣，进一步强化剧情节奏，极大丰富了剧集看点。正如观众评价“剧情跌宕起伏，观感极度舒适”。

影评:

1,纠缠与吵闹并不能使爱情维系持久。有时候，执着体现于无言的忍耐与默默的承受，貌似不爱，却更能使爱得以解脱，得以不朽。“不强求天长地久，只在乎曾经拥有。”其实这只是对天长地久的绝望。爱情是爱与爱的沟通，情与情的呼应，它无须形影相随，却要求心心相印。

2,佛学中有一个偈语是这样讲，春有百花秋有月，夏有凉风冬有雪，若无闲事挂心头，便是人间好时节。

3,所有的合适都是两个人的相互迁就和改变，没有天生合适的两个人。两个人朝着相同的方向努力，就是最好的爱情。

4,这是一部看起来很有趣的电影，影片的看点不只是其中的动作戏，更在于其中心角色的内心感情。

5,暗调和幽蓝是这部电影的主色调，这也是导演风格在形式上的一种体现，它的幽默也是冷峻中的惬意，对人物和画面的刻画细致入微。